- CSI-Wrocław http://www.csi-wroclaw.pun.pl/index.php - Informacje/Zdjęcia http://www.csi-wroclaw.pun.pl/viewforum.php?id=3 - BLASTN.txt http://www.csi-wroclaw.pun.pl/viewtopic.php?id=2 |
Wiktor - 2010-10-19 17:11:57 |
Zamieszczam plik BLASTN.txt, wszyscy dostaliście go na email, ale co tam. Kod:>1 ggcggggcctgcttctcctcagcttcaggcggctgcgacgagccctcaggcgaacctctcggctttcccgcgcggcgccgcctcttg ctgcgcctccgcctcctcctctgctccgccaccggcttcctcctcctgagcagtcagcccgcgcgccggccggctccgttatggcgac ccgcagccctggcgtcgtgattagtgatgatgaaccaggttatgaccttgatttattttgcatacctaatcattatgctgaggatttggaaag ggtgtttattcctcatggactaattatggacaggactgaacgtcttgctcgagatgtgatgaaggagatgggaggccatcacattgtagc cctctgtgtgctcaaggggggctataaattctttgctgacctgctggattacatcaaagcactgaatagaaatagtgatagatccattccta tgactgtagattttatcagactgaagagctattgtaatgaccagtcaacaggggacataaaagtaattggtggagatgatctctcaacttta actggaaagaatgtcttgattgtggaagatataattgacactggcaaaacaatgcagactttgctttccttggtcaggcagtataatccaaa gatggtcaaggtcgcaagcttgctggtgaaaaggaccccacgaagtgttggatataagccagactttgttggatttgaaattccagacaa gtttgttgtaggatatgcccttgactataatgaatacttcagggatttgaatcatgtttgtgtcattagtgaaactggaaaagcaaaatacaaa gcctaagatgagagttcaagttgagtttggaaacatctggagtcctattgacatcgccagtaaaattatcaatgttctagttctgtggccatc tgcttagtagagctttttgcatgtatcttctaagaattttatctgttttgtactttagaaatgtcagttgctgcattcctaaactgtttatttgcactat gagcctatagactatcagttccctttgggcggattgttgtttaacttgtaaatgaaaaaattctcttaaaccacagcactattgagtgaaacat tgaactcatatctgtaagaaataaagagaagatatattagttttttaattggtattttaatttttatatatgcaggaaagaatagaagtgattgaa tattgttaattataccaccgtgtgttagaaaagtaagaagcagtcaattttcacatcaaagacagcatctaagaagttttgttctgtcctggaa ttattttagtagtgtttcagtaatgttgactgtattttccaacttgttcaaattattaccagtgaatctttgtcagcagttcccttttaaatgcaaatc aataaattcccaaaaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa >2 gcggccgcaccccccggccgggccgtgcttctgcccctacaaggtttgggccgaggtgggggagggtcctggttgccggccccgc ccggtccctccccgccttttaggcgcccgcgtggccgggacgtcccagtcccgctccgtcctcctcgcctgccaccggtgcacccagt ccgctcacccagcccagtccgtccggtcctcaccgcctgccggccggcccaccccccaccgcagccatggacgccatcaagaaga agatgcagatgctgaagctggacaaggagaacgccatcgaccgcgccgagcaggccgaagccgacaagaagcaagctgaggac cgctgcaagcagctggaggaggagcagcaggccctccagaagaagctgaaggggacagaggatgaggtggaaaagtattctgaat ccgtgaaggaggcccaggagaaactggagcaggccgagaagaaggccactgatgctgaggcagatgtggcctccctgaaccgcc gcattcagctggttgaggaggagctggaccgggcccaggagcgcctggctacagccctgcagaagctggaggaggccgagaagg cggctgatgagagcgagagaggaatgaaggtcatcgaaaaccgggccatgaaggatgaggagaagatggaactgcaggagatgc agctgaaggaggccaagcacatcgctgaggattcagaccgcaaatatgaagaggtggccaggaagctggtgatcctggaaggaga gctggagcgctcggaggagagggctgaggtggccgagagtaaatgtggggacctagaggaggagctgaaaattgttaccaacaact tgaaatccctggaggcccaggcggacaagtattccaccaaagaagataaatatgaagaggagatcaaactgttggaggagaagctga aggaggctgagacccgagcagagtttgccgagaggtctgtggcaaagttggagaaaaccatcgatgacctagaagatgaagtctatg cccagaagatgaagtacaaggccattagcgaggaactggacaacgcactcaatgacatcacctccctctgagccccacgccagcgtg gccacctcagctctcttctctcctctcctttccattctctctatggggaggggagcaggcaggaggagcagaaattgccaacattgcaca gccaggctgggagcagcctagggagagcccccatcatgcccaccacccactctggcactggcttcatcctttacctatccccttccacc ctcctttgctgcttaataaattctgaacttggtctcca >3 ccaccgcagcggacagcgccaagtgaagcctcgcttcccctccgcggcgaccagggcccgagccgagagtagcagttgtagctac ccgcccagaaactagacacaatgtgcgacgaagacgagaccaccgccctcgtgtgcgacaatggctccggcctggtgaaagccgg cttcgccggggatgacgcccctagggccgtgttcccgtccatcgtgggccgcccccgacaccagggcgtcatggtcggtatgggtca gaaagattcctacgtgggcgacgaggctcagagcaagagaggtatcctgaccctgaagtaccctatcgagcacggcatcatcaccaa ctgggatgacatggagaagatctggcaccacaccttctacaacgagcttcgcgtggctcccgaggagcaccccaccctgctcaccga ggcccccctcaatcccaaggccaaccgcgagaagatgacccagatcatgtttgagaccttcaacgtgcccgccatgtacgtggccatc caggccgtgctgtccctctacgcctccggcaggaccaccggcatcgtgctggactccggcgacggcgtcacccacaacgtgcccat ttatgagggctacgcgctgccgcacgccatcatgcgcctggacctggcgggccgcgatctcaccgactacctgatgaagatcctcact gagcgtggctactccttcgtgaccacagctgagcgcgagatcgtgcgcgacatcaaggagaagctgtgctacgtggccctggacttc gagaacgagatggcgacggccgcctcctcctcctccctggaaaagagctacgagctgccagacgggcaggtcatcaccatcggcaa cgagcgcttccgctgcccggagacgctcttccagccctccttcatcggtatggagtcggcgggcattcacgagaccacctacaacagc atcatgaagtgtgacatcgacatcaggaaggacctgtatgccaacaacgtcatgtcggggggcaccacgatgtaccctgggatcgctg accgcatgcagaaagagatcaccgcgctggcacccagcaccatgaagatcaagatcatcgccccgccggagcgcaaatactcggtg tggatcggcggctccatcctggcctcgctgtccaccttccagcagatgtggatcaccaagcaggagtacgacgaggccggcccttcc atcgtccaccgcaaatgcttctagacacactccacctccagcacgcgacttctcaggacgacgaatcttctcaatgggggggcggctg agctccagccaccccgcagtcactttctttgtaacaacttccgttgctgccatcgtaaactgacacagtgtttataacgtgtacatacattaa cttattacctcattttgttatttttcgaaacaaagccctgtggaagaaaatggaaaacttgaagaagcattaaagtcattctgttaagctgcgt aaaaaaaaaaaaaaaaaaa >4 tggattgaaagcttagcctggtaaactattcccagctaaatggcatacgacgcatattaaacccacatccgagattaagatgcctattagg ctttcaccgagcgctagaagattgataatgctccccccattaatggttgatttatcaatgattaaggggagttgtgagctaatgattaaccct tggctaccgagtagattaattagacccatgagtagtttcgcattgatggagagtag >5 cctgcgtggctgggctgctcgggttagatcgtcaggaaaagcctaaagattagactgtaagaaaagaaaatagaagccatgtttcgaa gacctgtattacaggtacttcgtcagtttgtaagacatgagtccgaaacaactaccagtttggttcttgaaagatccctgaatcgtgtgcac ttacttgggcgagtgggtcaggaccctgtcttgagacaggtggaaggaaaaaatccagtcacaatattttctctagcaactaatgagatg tggcgatcaggggatagtgaagtttaccaactgggtgatgtcagtcaaaagacaacatggcacagaatatcagtattccggccaggcct cagagacgtggcatatcaatatgtgaaaaaggggtctcgaatttatttggaagggaaaatagactatggtgaatacatggataaaaataa tgtgaggcgacaagcaacaacaatcatagctgataatattatatttctgagtgaccagacgaaagagaaggagtagaaaggatgattctt ctttggccatcatttggtacagtctcatttccaagtcatgtataatctttatggcttccaaggacaagaattaaaatactcttttacgt |
olka - 2010-10-20 17:23:02 |
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi … =BlastHome podaję link do strony, która rozkminia ten plik. niestety, otrzymałam jakieś kosmiczne wyniki i ja ich nie ogarniam. może będziecie mieli więcej szczęścia :) |
Gosia - 2010-10-20 20:12:48 |
Ola, |
Grzesiek - 2010-10-20 23:04:25 |
mi się udało jedynie odnaleść, że jest to kod kwasu nukleinowego, konkretniej nazywa się on chyba fosforybozylotransferaza hipoksantynowo-guaninowa (http://pl.wikipedia.org/wiki/Fosforyboz … -guaninowa). z wikipedii można odczytać, że jest to enzym do odzyskiwania puryny ze zdegradowanego DNA. |
Gosia - 2010-10-21 10:00:05 |
Chyba muszę Wam podpowiedzieć, że każdą sekwencję (1,2,3,4,5) trzeba traktować osobno. |
olka - 2010-10-21 19:52:17 |
ok, idąc tym tropem, sprawdziłam 2 sekwencję. też jest to kwas nukleinowy. dokładnie cDNA, czyli DNA uzyskany przez odwrotną transkrypcję na matrycy mRNA uzyskanego z kom. wklejam link - http://pl.wikipedia.org/wiki/CDNA prawdobodobnie należy do bydła domowego (bos taurus) , makaka jawajskiego (Macaca fascicularis), bo takie nazwy się tam pojawiały :) |
Gosia - 2010-10-21 21:12:29 |
Jakbyś szukała w bazie DNA ludzkiego (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi … =blasthome) to znalazłabyś, że sekwencja jest 100% identyczna z genem kodującym tropomiozynę ludzką. To, że znalazłaś podobieństwo do makaka i krowy ;-) to nie jest nic dziwnego, ostatecznie ludzie są spokrewnieni z innymi zwierzętami ;-) |
olka - 2010-10-22 19:06:46 |
załatwiłam już wszystkie sekwencje: |
Gosia - 2010-10-22 20:38:42 |
O.K. Podsumujmy: |